吉林大学其实是一所很“奇葩”的高校，实力极强，事实上吉林大学合并高校中有两所211工程大学，一所是原吉林大学，另外一所则是吉林工业大学，而吉林工业大学早在1960年就列入全国重点大学行列，是国内车辆工程方面的“带头大哥”。但是就这样一所实力派高校，竟然经常被网友戏称“巨无霸”高校。

老吉林大学早期实力同南开大学差距并不大，属于伯仲之间的高校。吉林大学和南开大学都是1960年同期列入全国重点大学的高校。只是恢复高考之后，南开大学在经济方面实力更强，而且更为活跃，所以人才辈出的同时在国内影响力和知名度急速提升，这一时期原吉林大学确实同南开大学的实力有所差距。

不过，2000年之后吉林大学先后合并了多少高校，尤其是又合并了一所211工程大学的情况下，事实上吉林大学的实力已经远在南开大学之上了。虽然同期南开大学也合并了一些学校，但是合并的学校实力都比较弱，如果能合并天津医科大学这类高校，那当然另当别论了，毕竟天医大也是一所老牌211工程大学。但是南开大学这一时期主要合并的是天津对外贸易学院和中国旅游管理干部学院，本身实力并不强，难以撬动南开大学整体质量提升。

整体来看，吉林大学的综合实力确实胜过南开大学，这一方面是学校规模和学科广度的优势决定的，另一方面则是吉林大学已经剥离了巨额债务，有更多的精力和资金投入到科研领域中去。而南开大学依旧在文理方面领先，虽然计算机方面也在加速，但是同有极深功底的吉林大学相比，还是略有一些差距。因此，总体来讲，吉林大学要强于南开大学一些！

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